Avec la participation de ses sociétaires, elle organise annuellement sept conférences, sur des thèmes propres au Pays de Montbéliard, et une journée d'étude qui sont publiées et relatées dans ses bulletins et mémoires. Elle édite également des ouvrages hors-série, dont un fut couronné par un prix de l’Institut des Sciences morales et politiques en 1994, et La Lettre, liens avec ses adhérents, qui fait le point deux fois par an sur la marche de l'association.

La Société d’Émulation est à l'origine des deux musées de la Ville de Montbéliard (musée du Château et musée d'Art et d'histoire). Les collections de sciences naturelles, d’archéologie d’art et d’histoire qu’elle a rassemblées ont fait l’objet de deux donations à la ville en 1960 et 1992. Elle continue à justifier ses buts patrimoniaux en faisant de fréquentes donations pour accroître les collections des musées.

Sa bibliothèque, accessible au public, compte des ouvrages concernant Montbéliard et les publications de 85 sociétés savantes correspondantes.

Yves Pradeilles